ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA TUYẾN TRÙNG Caenorhabditis briggsae  Ở TỈNH NINH BÌNH, ĐỒNG NAI VÀ LÂM ĐỒNG, VIỆT NAM

Lê Thọ Sơn; Hà Bích Hồng; Bùi Thị Mai Hương; Nguyễn Thị Thu

Từ khóa:

Caenorhabditis briggsae, tuyến trùng, DNA barcoding, nuôi cấy, phân lập

Tóm tắt

Caenorhabditis briggsae là một trong số các loài tuyến trùng lưỡng tính và tự thụ tinh trong. Loài này là mục
tiêu mô tả trong chuỗi nghiên cứu đa dạng của giống Caenorhabditis ở những khu bảo tồn thiên nhiên. Nghiên
cứu này trình bày kết quả phân lập, nuôi cấy và mô tả phân tử của loài C. briggsae phân bố ở Vườn Quốc gia
Cát Tiên (tỉnh Đồng Nai và Lâm Đồng) và Cúc Phương (tỉnh Ninh Bình) của Việt Nam. Kết quả nghiên cứu
đã phân lập và nuôi cấy nhân tạo được 17 chủng C. briggsae thu từ Vườn Quốc gia Cát Tiên và 10 chủng thu
từ Vườn Quốc gia Cúc Phương. Độ tương đồng phân tử của trình tự 18S rDNA giữa các chủng giao động từ
99,53% đến 100% so với đối chứng C. briggsae AF16. Kết quả này cho thấy tiềm năng đa dạng cao của loài
tuyến trùng C. briggsae ở Việt Nam. Tiếp theo, chúng tôi hướng tới sử dụng các chủng tuyến trùng C.
briggsae từ hai Vườn để nghiên cứu mối quan hệ cấu trúc gen và tính đa hình tính trạng nói chung.
Từ khóa: Caenorhabditis briggsae, tuyến trùng, DNA barcoding, nuôi cấy, phân lập

Tài liệu tham khảo

1. Ahringer J., 2006. Reverse genetics. WormBook. WormBook, The C. elegans Research Community.

2. Barriere A. and M.A. Felix, 2005. "High local genetic diversity and low outcrossing rate in Caenorhabditis elegans natural populations." Curr Biol 15(13): 1176 - 1184.

3. Barriere A., Felix, M. A., 2006. Isolation of C. elegans and related nematodes. WormBook. T. C. e. R. Community, WormBook: 1 - 9.

4. Brenner S., 1973. "The genetics of behaviour." Br Med Bull 29(3): 269 - 271.

5. Caenorhabditis Evolution Community, 2020. List of available Caenorhabitis species and the state of their genome projects.

6. Chen H.H., 2011. Impact of natural sequence variation on aging in the recombinant inbred lines of Caenorhabditis elegans, ProQuest, UMI Disertation Publishing.

7. Croll N.A., J.M. Smith and B.M. Zuckerman, 1977. "The aging process of the nematode Caenorhabditis elegansin bacterial and axenic culture." Exp Aging Res 3(3): 17 5 - 189.

8. Felix M.A., R. Jovelin, C. Ferrari, S. Han, Y.R. Cho, E.C. Andersen, A.D. Cutter and C. Braendle, 2013. "Species richness, distribution and genetic diversity of Caenorhabditis nematodes in a remote tropical rainforest." BMC Evol Biol 13(10): 1 - 13.

9. Fodor A., D.L. Riddle, F.K. Nelson and J.W. Golden, 1983. "Comparison of a new wild-type Caenorhabditis briggsae with laboratory strains of C. briggsae and C. elegans". Nematologica 29: 203 - 217.

10. Gupta B.P., R. Johnsen and N. Chen, 2007. "Genomics and biology of the nematode Caenorhabditis briggsae." WormBook: 1 - 16.

11. Kanzaki N., I.J. Tsai, R. Tanaka, V.L. Hunt, D. Liu, K. Tsuyama, Y. Maeda, S. Namai, R. Kumagai, A. Tracey, N. Holroyd, S.R. Doyle, G.C. Woodruff, K. Murase, H. Kitazume, C. Chai, A. Akagi, O. Panda, H.M. Ke, F.C.

Schroeder, J. Wang, M. Berriman, P.W. Sternberg, A. Sugimoto and T. Kikuchi, 2018. "Biology and genome of a newly discovered sibling species of Caenorhabditis elegans". Nat Commun 9(1): 3216.

12. Le T.S. and H.D. Nguyen, 2021. "Isolation, cultivation, and lifespan of the nematode Caenorhabditis brenne ri in Vietnam" .

13. Le T.S., T.T.H. Nguyen, B. Thi Mai Huong, H.G. Nguyen, B.H. Ha, V.S. Nguyen, M.H. Nguyen, H.H. Nguyen and J. Wang, 2021. "Cultivation of Caenorhabditis elegans on new cheap monoxenic media without peptone".J Nematol 53.

14. Le T.S., F.J. Yang, Y.H. Lo, T.C. Chang, J.C. Hsu, C.Y. Kao and J. Wang, 2017. "Non-Mendelian assortment of homologous autosomes of different sizes in males is the ancestral state in the Caenorhabditis lineage". Sci Rep

(1): 12819.

15. Nuez I. and M.A. Felix, 2012. "Evolution of susceptibility to ingested double-stranded RNAs in Caenorhabditis nematodes." PLoS One 7(1): e29811.

16. Tamura K., G. Stecher and S. Kumar, 2021. "MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11".Mol Biol Evol 38(7): 3022 - 3027